SCDE (Single-Cell Differential Expression) 是一个用于单细胞转录组数据分析的工具，旨在识别在不同细胞类型或条件下的基因差异表达情况。SCDE 基于单细胞RNA测序数据，通过模型化单细胞基因表达的分布，考虑了数据中的噪声和稀疏性，实现了准确的差异表达分析。其主要原理是通过贝叶斯方法估计每个基因在不同细胞中的表达水平，并计算差异表达的置信度。这种方法在细胞间和基因间的变异中引入了随机性和不确定性，更准确地捕捉了单细胞数据的特点。与传统的差异表达分析方法相比，SCDE 能更好地处理单细胞数据的特异性，提供更可靠的结果。通过对单细胞转录组数据的精细分析，SCDE 有助于推动我们对细胞异质性的深入理解。