SpectraPlot是一种用于处理和分析光谱数据的软件工具。

MaxQuant是一个用于质谱数据分析的计算工具，它专注于液相色谱-质谱（LC-MS）和气相色谱-质谱（GC-MS）等高通量质谱数据的定量和鉴定分析。

MS-DIAL（Mass Spectrometry Data Independent Analysis for Lipidomics）是一款用于脂质组学数据分析的开源软件。

Mascot是由Matrix Science公司开发的蛋白质鉴定和分析软件，该软件用于解析质谱数据，鉴定蛋白质和肽段。

Bruker的Compass DataAnalysis是一款用于质谱数据处理和分析的软件。

Agilent Technologies的MassHunter是一款用于质谱数据分析的软件平台。

MassLynx是Waters公司开发的质谱数据分析软件。

Proteome Discoverer是由Thermo Fisher Scientific开发的蛋白质组学数据分析软件。

Skyline是一个用于质谱数据分析的开源软件，其主要用途是用于液相色谱-质谱（LC-MS）和气相色谱-质谱（GC-MS）数据的定量和定性分析。

ProteoWizard是一个开源的生物信息学工具集，其主要用于质谱数据的处理和分析，旨在提供高效、灵活的工具，满足蛋白质组学领域的研究需求。

ms-utils是一个针对质谱（Mass Spectrometry）数据分析的在线工具平台。

OpenMS是一种开源的质谱数据分析软件，用于处理和解释质谱数据。