Phyre2用于蛋白质结构预测和分析。其核心原理是基于蛋白质序列之间的保守性以及结构与功能之间的关联性。Phyre2通过比对待预测蛋白质的序列与已知结构的蛋白质数据库，寻找具有相似序列和结构特征的蛋白质，进而预测目标蛋白质的可能结构。该工具在模板选择、多模板模建以及模型评估等方面具备高度智能化和自动化。Phyre2为科研人员提供了一种快速、准确、高通量的方法，帮助揭示蛋白质的三维结构，从而更好地理解蛋白质的功能机制以及在疾病治疗等方面的应用潜力。