MSConvert是一个质谱数据格式转换工具，它旨在将不同仪器和数据格式的质谱数据转换为更通用和可处理的开放格式，方便后续的数据分析和解释。MSConvert的定义是一个开源工具，用于将质谱数据从多种原始格式（如仪器厂商特定格式）转换为标准化格式，如mzML、mzXML等。其原理基于ProteoWizard库，通过解析原始数据文件，提取质谱谱图、质荷比和强度等信息，然后重新构建为开放格式，以便在各种质谱分析软件中进行处理。该工具促进了质谱数据的互操作性和共享。它在质谱数据预处理、分析和解释中起到关键作用，为不同研究领域如蛋白质组学、代谢组学、脂质组学等提供了便利。通过标准化数据格式，研究人员能够更轻松地比较不同样本、实验条件和实验室之间的数据。