MaxQuant是一个用于质谱数据分析的计算工具，它专注于液相色谱-质谱（LC-MS）和气相色谱-质谱（GC-MS）等高通量质谱数据的定量和鉴定分析，旨在帮助研究人员从复杂的蛋白质样本中提取有关蛋白质和肽段的信息。MaxQuant的工作原理基于高级计算算法。它支持多种质谱数据格式，提供了数据导入、质谱图解释、肽段和蛋白质鉴定、定量分析、蛋白质修饰分析等功能。该软件采用多级搜索策略，有助于鉴定低丰度蛋白质和修饰。在蛋白质组学研究中，MaxQuant用于鉴定复杂样本中的蛋白质、定量分析蛋白质的表达水平、发现修饰以及解析蛋白质相互作用等。该软件在生物医学研究、生物学领域发挥关键作用，有助于深入理解蛋白质的功能和相互关系。