Fpocket是一种用于蛋白质结构中口袋预测和分析的计算工具。它可以帮助研究人员识别蛋白质结构中的潜在活性位点和结合口袋，从而有助于药物设计和生物活性研究。Fpocket的原理是基于分子动力学模拟和聚类分析。它通过对蛋白质结构进行模拟，模拟分子在结构中的运动和相互作用，然后使用聚类算法将相似的结构聚集在一起。通过分析这些聚类结构，Fpocket可以确定蛋白质结构中的口袋和潜在的结合位点。